华大智造副总裁刘健向参会者介绍新产品。
10月27日,在第十二届国际基因组学大会上,华大基因集团旗下公司华大智造发布了两个新款高通量测序系统——MGISEQ-2000和MGISEQ-200。至此,华大在高通量测序方面已拥有四款产品。2015年、2016年,华大先后发布首款桌面型高通量测序系统BGISEQ-500、高通量台式测序系统BGISEQ-50。
在产品基本参数差别不大的情况下,“便宜”是华大测序仪吸引购买者的重要因素。此次,除测序时间与读长方面的改进外,这两款新产品依旧保持了低成本购机、低成本运营这一特点,华大智造副总裁蒋慧甚至在发布会上表态,“MGISEQ-200是100万元以内性能最强的测序平台,MGISEQ-2000是单G成本八美元以内平台成本最低的测序仪。”
在这两款产品发布的同时,华大还发布了基因组解码计划,这个计划则号称将“基于华大BGISEQ平台,提供快速、准确、经济的全基因组测序服务,期望在三年时间内,推动基因组测序由百元美金跨入百元人民币时代。”
更短时间测更多数据?
“缩短测序时间”是MGISEQ-2000和MGISEQ-200与旧产品相比的一个进步。
蒋慧在介绍新产品时提到,MGISEQ-200目前支持SE50、SE100、PE50、PE100四种读长,未来还可以支持SE200的读长。与BGISEQ-50相比,在PE100读长模式下满负荷运行可产生60G的下机数据,仅需不到48小时,平均一天能完成24个肿瘤样本的检测。此外,MGISEQ-200与BGISEQ-50一样,可以在高海拔区域自如运用。
同时发布的桌面测序仪MGISEQ-2000则继承了BGISEQ-500的双芯片独立运行平台的特点,可使用2流道和4流道两种规格的芯片。与此同时,它集成了加载系统,与旧产品相比,操作更加简单方便。在数据产出方面,MGISEQ-2000单次运行能够完成最大600G的下机数据,在PE100读长模式下满负荷运行仅需不到48小时,一年的运行通量相当于1000个以上人全基因组数据量。未来,MGISEQ-2000将支持PE150和SE300的读长。
MGISEQ-200和MGISEQ-2000使用芯片对比。
“相比之下,MGISEQ-2000目前最多每天可以产出300G数据,比较适合科研机构和一些有大量测序需求的医疗机构使用,而MGISEQ-200每天最多可以产出30G数据,更适合样本量比较小的机构使用。”华大智造副总裁刘健告诉健康点记者,由于两款新产品都属于级别最高、监管最严格的三类医疗器械,审查周期较长,非临床医学机构是华大测序仪的初始购买方,其中,华小系企业也将贡献不少购买力。刘健强调,“目前仅科研机构对这两个产品的预定量就已经超过了100台。”
在新品发布前,华大选择了一批老用户“尝鲜”。其参与投资的北京吉因加科技在体验过新机器后提供了这样一个数据:MGISEQ-2000目前3 run的测序错误率为5.4‰,BGISEQ—500的错误率是2‰左右。对此,刘健表示,“虽然这两个数据都已经属于国际领先水平,但由于MGISEQ-2000还处于比较早期,相信在准确性方面,能很快达到甚至超过BGISEQ-500。”
对于高通量测序仪来说,成本、速度、准确性、读长、通量等几个重要指标往往很难兼顾。相比较于BGISEQ—500而言,MGISEQ-2000在速度、成本、准确性和读长等之间找到了一个相对更优化的平衡点。北京吉因加科技赵美茹则指出,“虽然MGISEQ-2000比BGISEQ—500的错误率稍高,但仍低于Illumina的Nextseq等平台,可以满足我们的需求,此外,MGISEQ-2000比BGISEQ—500的稳定性更好,速度也更快。”
核心零件逐步实现国产化
对于一款测序仪来说,“核心零件靠进口”这一点大大增加了其制造成本,而这个问题也一直困扰着我国的测序仪制造企业。
华大智造副总裁蒋慧进行新品发布。
据国家食药总局官方网站显示,在华大智造这两款产品发布前,我国已经批准的国产基因测序仪共有八款,分别是华大基因集团的BGISEQ-100和BGISEQ-1000、BGISEQ-500、达安基因的DA8600、华因康的HYK-PSTAR-IIA、博奥生物的BioelectronSeq4000、贝瑞和康的NextSeq CN500以及安诺优达的NextSeq 550AR。其中DA8600、BioelectronSeq4000、BGISEQ-100为贴牌的Life Technologies 的Proton平台,NextSeq CN500、NextSeq 550AR为贴牌的Illumina的Nextseq平台,BGISEQ-1000是基于华大收购的CG的既有平台,而只有华大的BGISEQ-500和华因康的HYK-PSTAR-IIA是属于自主知识产权。
国家发改委公众号的文章中提到,华大是世界上拥有二代基因测序仪最多的机构之一,共计约有华大生产的1000多台基因测序及相关设备应用于全球各地的科研及医疗机构。对于华大而言,实现核心零部件的国产化将在很大程度上降低其生产成本。
对此,华大确实也做出了探索。2013年3月,华大基因集团收购了美国基因测序仪公司Complete Genomics,提升了其基因测序仪的生产能力。
“实际上,近年来测序仪零部件的国产化率在不断提高。”刘健告诉健康点,“基因测序仪生产所需的数千个高精密零部件在国产基因测序仪发展的同时也可以逐渐实现国产化,有助于带动供应链上国内高科技企业的进步。而对于华大来说,物料供货周期缩短且成本也随之降低。”
基因组测序即将进入百元时代?
将基因组测序成本降低至百元以下,这是华大在新品发布会上展示的美好愿景。其与两款测序仪同时发布的基因组解码计划希望通过华大BGISEQ平台,推动基因组测序由百元美金跨入百元人民币时代。
MGISEQ-200(左)和MGISEQ-2000(右)样机。
华大科技副总经理徐均阳表示,“全基因组测序是目前大规模获得个人高质量基因序列信息的主要手段,解码基因组计划将使得人类基因组的研究更透彻,这些海量的数据将被用于评估个人健康和疾病。”
据徐均阳介绍,整个基因组解码计划将分为三期来进行,在未来的三年时间内,华大将分别为10万、20万、50万的人群提供全基因组解码方案,并对项目的规模、时间以及技术全程把控。”她表示,“我们期望借助这个计划,集合行业内的力量,促进基因科技在人群数据库的构建、健康计划的制定、药物的研发、肿瘤疾病的研究等相关方面的应用和转化。”
理想虽然很丰满,但现实却很骨感。目前,行业的平均基因测序成本是800美金左右,而华大也只是对外表示BGISEQ-500目前的全基因组检测成本是600美金。相比于100元人民币的目标,这个成本想降下来并不容易。
“这个成本是可以降低的。”刘健告诉健康点,“从1000美元到600美元,这个过程中,主要降低的是耗材的成本还有仪器的折旧成本。”他解释到,想要降低全基因组的测序成本,一方面要降低测序仪的成本,另一方面也要降低耗材的成本,未来随着测序仪国产化的逐步完善,这两部分成本都会持续降低。
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作者:码万祺 时间:2024-03-29 17:52:17 文章来源:原创
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