物理治疗作用发挥是民营医院区别于公立医院的显著标志，物理治疗在专科疾病治疗的效果发挥上起到了无可替代的作用，同时物理治疗也是民营医院重要盈利点之一。然而有许多因素影响到物理治疗的效果，并产生负面反映，如何进一步发挥物理治疗的效用，有效降低物理治疗操作及经营的负面影响，成为新时期民营医院经营者必须考虑的问题。综合中小民营医院物理治疗现状，大概有如下几个影响因素：
1、物理治疗的基础理论培训不足，对物理治疗技术的理解掌握不充分
纵观各民营医院的物理治疗操作流程，讲究实用和简洁，对于设备的原理和作用介绍不充分，很多治疗人员甚至是临床医生，对于物理治疗的原理和设备的性能并不全面和深入的了解与掌握，这样，在不同的治疗方法与设备选择上，难以做到精细化，降低了物理治疗的疗效。
出现这个问题的原因在于：以中专或中专转大专毕业为主体的治疗人员，多为初中毕业，没有系统学习物理学相关知识，医院对这方面有全面了解的专业人员缺乏，对物理学的理论培训不足。所以加强对接诊医生和治疗人员的物理治疗技术基础系统培训是改善物理治疗技术正确选择和使用的关键。
2、技术操作流程较为粗糙，人文关怀欠缺，已经不能适应新医学模式的要求
现在教科书、各医院的物理治疗操作规范是基于生物医学模式的要求设计的，没有借鉴社会医学和心理医学的模式要求。在治疗操作中，可能有轻柔操作的提示，但对于操作产生的舒适性、杜绝伤害、防止疼痛和不适方面缺乏精细的流程操作要领。特别是涉及生殖医学疾病治疗，操作部位多为性敏感区，更没有按照性生理和性心理的规律，消除性恐惧、防止性不适、避免性尴尬，同时如何避免操作者和患者的性别角色认知，都是物理治疗中经常发生的社会医学模式影响问题。
另外，从心理治疗上来说，物理治疗是非常有效的心理暗示治疗方法，但目前的医学界只认可物理治疗的生物学意义，不认可甚至是反感和排斥物理治疗的心理暗示治疗意义，常常把民营医院的物理治疗看成是过度治疗。这是典型的生物医学观，单纯持这种医学思维很难让患者在疾病病理恢复后，症状上和社会适应上恢复到健康的表现。
所以，中小民营医院的物理治疗流程背离新医学模式，要依照社会—心理—生物医学模式，进行流程设计或再造，其目标要满足于消除或减少疼痛和创伤、提高舒适度、增强愉悦度，满足疗效。
3、物理治疗经营落后于医疗市场发展，治疗中断率高
（1）技术普及但价格未相应调整：民营医院物理治疗经过近20年的发展，已经让公立医院广泛接受物理治疗的价值和意义，并在公立医院得到同样的广泛应用。但物理治疗的价格并未随着治疗技术的广泛普及而做大幅度的调整。这样让一部分物理治疗的患者转向选择那些治疗价格较低的民营医院或者公立医院，造成患者中断治疗。
（2）物理治疗费用比过高：民营医院已经或正在由门诊型转向住院型医疗，门诊型医疗的利润点在治疗费，而住院型医疗的利润点主要是检查费和手术费，如果不改变治疗费所占比重，不但会影响到住院医疗战略的实现，更会导致过度医疗的社会印象形成，造成患者中断治疗、不选择或放弃住院医疗。
（3）物理治疗结构不合理：物理治疗中忽视中医治疗，单纯追求高端物理治疗。应重视基础物理治疗，针灸理疗是受患者欢迎和社会普遍认可的物理治疗，而高端物理治疗的范围局限，人群有限，如果当作常规治疗项目，可能影响到中低端患者对物理治疗的接受程度，导致患者不得不中断治疗疗程而放弃在院诊疗。
因此，及时配备中医物理治疗室，把中医治疗和基础物理治疗作为常规治疗，把高端物理治疗项目作为选择性治疗项目，对于患者来说，他们会认知高端物理治疗是更有吸引力和更有疗效的治疗，对于有更高需求的患者可能更乐于接受，不断是满意效果的体现也是尊贵身份的体现。
4、管理不规范
（1）物理治疗人员专业结构不统一：有临床专业的，有护理专业的，对于临床专业与护理专业人员的工作职责没有作区分，以至技术操作要领掌握不统一，医患沟通思维难以一致。治疗人员的技术操作和沟通水平参差不齐，影响到主诊医生和患者的感受及信任度。
（2）治疗室管理不规范：有归口经营部门，也有归口护理部门管，也有双方共管。治疗室环境往往达不到医院感染控制和护理管理对治疗室的要求。
（3）物理治疗与临床分离：治疗室作为独立的业务单元，脱离临床甚远，加上有些与临床联系不够紧密，使患者的主诊医生脱离患者的治疗操作，不但降低了疗效，也让医生与患者的密切程度受到影响，降低患者对医生的依从性。
从医疗市场的角度来看，加强物理治疗的标准化和规范化管理已经成为医院职业院长的当务之急，同时也要制定分级治疗规范，哪些治疗由医生本操作，哪些治疗由临床专业人员操作，哪些治疗由护理人员操作。只有把物理治疗管理抓好了，医院的质量、口碑和经营效益才会有进一步的提升。